Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms