Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RhodP97348 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RhodP97348 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RhodP97348 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms