Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms