Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tubg1P83887 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.3 ms