Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ptprn2P80560 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms