Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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