Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms