Protein–RNA interactions for Protein: P56473

Agrp, Agouti-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrpP56473 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
AgrpP56473 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
AgrpP56473 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms