Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lbx1P52955 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lbx1P52955 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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