Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
TspoP50637 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms