Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tmod1P49813 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms