Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtpreP49446 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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