Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab11bP46638 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms