Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbP41155 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LtbP41155 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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