Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rpl28P41105 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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