Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
VhlP40338 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
VhlP40338 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VhlP40338 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VhlP40338 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms