Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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