Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprkP35822 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms