Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm10419-201ENSMUST00000100944 1671 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxa10P31310 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms