Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RxraP28700 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxraP28700 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RxraP28700 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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