Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd10P28359 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Hoxd10P28359 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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