Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms