Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nfkb1P25799 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nfkb1P25799 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms