Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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PparaP23204 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PparaP23204 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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PparaP23204 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PparaP23204 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PparaP23204 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PparaP23204 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms