Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SftpcP21841 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms