Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P20040 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P20040 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P20040 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms