Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PdgfaP20033 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PdgfaP20033 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms