Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ms4a1P19437 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ms4a1P19437 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ms4a1P19437 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ms4a1P19437 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ms4a1P19437 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ms4a1P19437 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ms4a1P19437 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms