Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm37036-201ENSMUST00000192836 2506 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DmdP11531 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
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DmdP11531 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
DmdP11531 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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DmdP11531 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
DmdP11531 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
DmdP11531 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms