Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccl20O89093 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccl20O89093 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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