Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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DffaO54786 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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DffaO54786 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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DffaO54786 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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DffaO54786 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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DffaO54786 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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DffaO54786 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms