Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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