Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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