Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C0

Gm6401, Predicted gene 6401 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6401L7N2C0 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm6401L7N2C0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6401L7N2C0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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