Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm2888K7N746 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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