Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Taf4bG5E8Z2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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