Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ScaperF8VQ70 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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