Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SmgcF6VRN1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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