Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm6555-201ENSMUST00000195167 789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms