Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms