Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3543D3Z235 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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