Protein–RNA interactions for Protein: C0HKE2

Hist1h2ac, Histone H2A type 1-C, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2acC0HKE2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hist1h2acC0HKE2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms