Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nipsnap3aB1AWZ3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms