Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm3371-202ENSMUST00000177827 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm37396-201ENSMUST00000191827 1495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prr29B1ARI9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms