Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Atp8b5A3FIN4 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Atp8b5A3FIN4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Atp8b5A3FIN4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Atp8b5A3FIN4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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