Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms