Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sfrp4Q9Z1N6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms