Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Syngr4Q9Z1L2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms