Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
ChmQ9QXG2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms