Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2bQ9JME9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vstm2bQ9JME9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vstm2bQ9JME9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms